Kursplan

Introduktion till Fiji och ImageJ

  • Översikt över Fiji och dess tillämpningar inom vetenskaplig forskning
  • Förståelse för ImageJs arkitektur och plugins
  • Installation och konfiguration av Fiji för optimal prestanda

Grundläggande bildbehandlingstekniker

  • Bildintagning och importformat
  • Justering av kontrast, ljusstyrka och tillämpning av filter
  • Bildstackning och projectionsmetoder

Avancerad Image Analysis

  • Sektionsmetoder: tröskelvärden och kantdetektering
  • Objektuppskattning och partikelanalys i histologiska prover
  • Mätning av områden, omkretsar och andra morfologiska egenskaper

Arbeta med Biologiska prover

  • Bearbetning av bilder av histologiska vävnader, blodceller och alger
  • Färganalys och analys av färgade vävnader
  • Tidslappsanalys och spårning av cellers rörelse

Automatisering och anpassning

  • Skapa och köra makron för repetitiva uppgifter
  • Använda Fiji-plugin-program för specialanalyser
  • Grundläggande skripting med ImageJ Macro Language (IJM)

Data Management och rapportering

  • Exportera resultat och generera rapporter
  • Annotera bilder och förbereda data för publicering
  • Bästa praxis för reproducerbar bildanalys

Sammanfattning och nästa steg

Krav

  • Grundläggande förståelse för biologiska avbildningskoncept
  • Bekantskap med mikroskopi och histologiska tekniker
  • Grundläggande datorkunskaper

Publik

  • Forskare inom bioteknik och miljötoxikologi
  • Laboratorietekniker som arbetar med histologisk och cellulär avbildning
  • Scientister som är intresserade av kvantitativ bildanalys
 14 timmar

Antal deltagare


Price per participant

Upcoming Courses

Relaterade Kategorier