Cursuri de pregatire Fiji: Image Processing for Biotechnology and Toxicology

Introducere în Fiji și ImageJ

• Prezentare generală a Fiji și a aplicațiilor sale în cercetarea științifică
• Înțelegerea arhitecturii și a plugin-urilor ImageJ
• Instalarea și configurarea Fiji pentru performanțe optime

Tehnici de bază de procesare a imaginilor

• Achiziționarea imaginilor și formatele de import
• Reglarea contrastului, a luminozității și aplicarea filtrelor
• Metode de stivuire și proiecție a imaginilor

Tehnici avansate Image Analysis

• Tehnici de segmentare: thresholding și detectarea marginilor
• Numărarea obiectelor și analiza particulelor în probele histologice
• Măsurarea suprafețelor, a perimetrelor și a altor caracteristici morfologice

Lucrul cu eșantioane Bio logice

• Prelucrarea imaginilor de țesuturi histologice, celule sanguine și alge
• Deconvoluția culorilor și analiza țesuturilor colorate
• Analiza time-lapse și urmărirea mișcării celulelor

Automatizare și personalizare

• Crearea și rularea de macro-uri pentru sarcini repetitive
• Utilizarea plugin-urilor Fiji pentru analize specializate
• Scripting de bază cu ImageJ Macro Language (IJM)

Data Management și raportare

• Exportul rezultatelor și generarea de rapoarte
• Adnotarea imaginilor și pregătirea datelor pentru publicare
• Cele mai bune practici pentru analiza reproductibilă a imaginilor

Rezumat și pași următori